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國(guó)家基因庫(kù)谷子數(shù)據(jù)庫(kù)正式發(fā)布

2015-07-10 10:07:00 來(lái)源:央廣網(wǎng)

  央廣網(wǎng)深圳7月10日消息(記者鄭柱子 通訊員劉旭林)國(guó)家基因庫(kù)谷子數(shù)據(jù)庫(kù)建設(shè)完成并于7月8日正式開(kāi)放,將免費(fèi)公開(kāi)2000多份谷子資源信息及部分以谷子為模式生物的基因功能研究成果等一系列數(shù)據(jù)信息。

  谷子是中國(guó)古代的“五谷”之首,其脫殼前被稱(chēng)為谷子,脫殼后被稱(chēng)為小米,其與玉米、高粱、甘蔗、珍珠粟、糜子、柳枝稷等禾谷類(lèi)糧食、能源作物近緣,具有抗旱、耐瘠薄、高光效以及基因組小、生育期短等突出優(yōu)勢(shì)。

  我國(guó)是谷子種植的最大的起源中心,也是當(dāng)前世界第一大主產(chǎn)國(guó),我國(guó)谷子種植面積占全球谷子種植面積的80%。

  自2009年起,華大基因就開(kāi)始了以谷子為模式生物的基因組學(xué)及分子育種研究工作,并與國(guó)內(nèi)多家科研院所合作,通過(guò)大規(guī)模挖掘谷子基因資源,批量獲取和保護(hù)了谷子的遺傳信息核心知識(shí)產(chǎn)權(quán),完成了谷子基因組圖譜的繪制,揭示出谷子抗旱節(jié)水、豐產(chǎn)、耐瘠等生理機(jī)制,采用全基因組分子育種技術(shù)培育出了更高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)、抗逆的雜交谷子新品系列。

  國(guó)家基因庫(kù)建設(shè)的谷子數(shù)據(jù)庫(kù)整合了大量研究成果,不僅能夠直觀展示和檢索查詢(xún)2000多份谷子種質(zhì)和表型性狀的資源信息(包括單個(gè)樣本的多維重要表型信息),還可展示全基因組重要性狀關(guān)聯(lián)基因位點(diǎn),后續(xù)將開(kāi)放相關(guān)信息檢索功能,為谷子研究提供了重要的數(shù)據(jù)庫(kù)支撐。此外,該數(shù)據(jù)庫(kù)也為普通民眾提供谷子科普知識(shí),期望能讓更多的人關(guān)注谷子、認(rèn)識(shí)谷子、走進(jìn)谷子,并推動(dòng)谷子研究的發(fā)展。

  未來(lái),國(guó)家基因庫(kù)谷子數(shù)據(jù)庫(kù)http://db.cngb.org/millet/ 還將開(kāi)放谷子鑒定分析預(yù)測(cè)模型系統(tǒng),該系統(tǒng)將基于谷子的多組學(xué)研究成果,結(jié)合生物大數(shù)據(jù)的發(fā)展,利用機(jī)器學(xué)習(xí)方法開(kāi)發(fā)而成,屆時(shí)將為揭示谷子抗旱節(jié)水、豐產(chǎn)、耐瘠和高光合作用效率等生理機(jī)制及其他相關(guān)生物學(xué)研究和谷子新品系選育提供更加全面有效的數(shù)據(jù)庫(kù)平臺(tái)支撐。

編輯:劉拓

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