疫情牽動著人們的心,病毒基因組測序分析工作尤為迫切。為支持北京市疫情防控技術需要,中國疾控中心病毒病所應急技術中心在6月11日接收到北京市疾控中心送檢4份病例標本后,馬上開展核酸檢測與基因組測序等應急支撐工作,6月12日第一時間完成相關病例樣本病毒全基因組序列測定和分析工作,并及時報告給國家衛(wèi)健委及北京市相關部門,為北京新冠肺炎疫情防控與病毒溯源提供重要科技支撐。
這次中國疾控中心迅速完成病毒全基因組序列測定和分析工作,“中國CDC應急技術中心-百度基因測序工作站”發(fā)揮了重要作用。中國疾控中心病毒病所應急技術中心主任譚文杰表示,基于團隊前期建立優(yōu)化的新冠全基因組測序技術方案,借助百度資助的先進測序儀,樣本接收后10個小時即完成了北京四個樣本的全基因組測序。這也是百度的AI大數據能力支持的“中國CDC應急技術中心-百度基因測序工作站”首戰(zhàn)告捷。
為共同推動新冠肺炎病毒基因組分析與新型疫苗研究工作,今年4月,百度與中國疾病預防控制中心病毒病預防控制所簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議,雙方聯合設立“中國CDC應急技術中心-百度基因測序工作站”。同時,百度為該工作站配備了一整套先進的二代與三代測序設備平臺,并協(xié)商制定了全面開展新冠肺炎相關研究的合作計劃,基于百度研發(fā)的線性二級結構預測算法LinearFold、mRNA疫苗二級結構設計算法LinearDesign、Covseq新型冠狀病毒分析溯源可視化平臺等領先技術,助力新冠肺炎相關研究,并長期支持公共衛(wèi)生相關科學研究。
疫情爆發(fā)以來,百度持續(xù)運用AI、大數據等前沿技術助力疫情防控。
目前,百度研究院研發(fā)的線性二級結構預測算法LinearFold已經陸續(xù)在各基因檢測機構、防疫中心及全世界科學研究中心投入應用。LinearFold可將此次新型冠狀病毒的全基因組二級結構預測從55分鐘縮短至27秒,提速120倍,節(jié)省了兩個數量級的等待時間,是RNA結構預測領域40年來第一次重大提速。1月30日,百度已向全球免費開放LinearFold算法及世界上現有最快的RNA結構預測網站,以提升新型冠狀病毒RNA空間結構預測速度。
基于LinearFold算法,百度研究院5月推出全球首個mRNA疫苗基因序列設計算法LinearDesign,專門用于優(yōu)化mRNA序列設計的高效算法。LinearDesign能在16分鐘內大大提升mRNA疫苗設計的穩(wěn)定性和蛋白質表達水平,大大加速疫苗研發(fā)速度。中國疾病預防控制中心后續(xù)將使用LinearDesign算法設計的mRNA疫苗序列進行體外實驗,驗證疫苗的穩(wěn)定性和蛋白質表達效率。
當下新型冠狀病毒還在持續(xù)變異中,對病毒進行監(jiān)控、溯源和研究追蹤對于了解疫情源頭,控制疫情傳播至關重要。百度也將持續(xù)和中國疾控中心病毒病所合作,以“中國CDC應急技術中心-百度基因測序工作站”為基地,提供包括病毒進化樹分析,病毒變異追蹤、溯源、可視化等一體化算法能力,幫助后者實現快速病毒測序,分析和監(jiān)控,共同推動新冠肺炎相關研究,早日戰(zhàn)勝疫情。